Prism gir deg muligheten til å lagre prosjektet i PZF, .PZFX og Compact PZF formater. PZF-filen er lagret i et binært format og var det primære formatet til versjon 5 av Prism når det ble erstattet av PZFX-formatet. Det er flere fordeler å lagre i PZFX-format, men det har vært rapporter om problemer med å åpne PZFX-filer sendt via e-post som er løst ved å lagre Prism-data i det eldre PZF-formatet. Også, dagens versjoner av Prism støtter fortsatt PZF-formatet. Det kompakte PZF-formatet er et annet alternativ, da det lar deg lagre Prism-prosjektet i PZF-formatet, men uten anlysis-resultatene (for å spare plass), som må rekomputeres når du åpner filen.
GraphPad Prism brukes primært av biologer, studenter og fysiske og sosiale forskere på universiteter, medisinske sentre og farmasøytiske selskaper over hele verden. Programmet inneholder vitenskapelige grafikkverktøy, ikke-lineær regresjonskurvefitting og biostatistikk for analyse av data og generering av grafer som kan publiseres til nettsteder, .DOCX filer og .PPTX filer.