.cram Filutvidelse
Filtype Compressed Alignment File
Utvikleren | EBI |
Kategori | Data Files |
Format | Binary |
.CRAM alternativnummer
Komprimert justeringsfilformat utviklet av EBI, en utstasjon fra European Molecular Biology Laboratory; lagrer korte DNA-sekvenslestjusteringer generert fra korte lesejusteringer som BWA, BBMap og BLAT.
Filformatet CRAM ligner filformatet Binary Alignment / Map (BAM), men har bedre filkomprimering og et omstrukturert kolonneorientert binært containerformat. Etter hvert som dataene øker i det genetiske programvarefeltet, ble CRAM-formatet utformet for å redusere diskfotens utskrift av justeringsdata.
Kort lesjustering er prosessen med å dechifisere hvor en sekvens kommer fra i genomet. Dette kan være vanskelig siden referansegenomet er ganske stort og du søker ikke alltid etter eksakte kamper i referansegenomet. Kortlesejustere brukes til å søke enorme sekvenser for kamper og nær-kamper. Siden sekvensene er så store, er komprimering gitt av formater som CRAM nødvendig for å holde filstørrelsene håndterbare.
Windows |
|