Integrerad Genome Browser

Programgranskning

Integrated Genome Browser (IGB) är ett program med öppen källkod som används för att visa och utforska stora genomiska datamängder. Du kan visa olika dataformat, interagera med dina data, skapa grafer, spara din information som bilder och dela data med medarbetare.

IGB låter dig visa data från anteckningar och justerade sekvenser. Programmet stöder ett antal format som FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband och GenBank. Du kan ta data och omvandla den till en mängd olika grafformer, inklusive felstaplar för att markera dataskillnader och djupdiagram för att visa täckning. Du kan också interagera med dina data genom IGB:s zoom- och panoreringsanimationer.

IGB låter dig komma åt och ladda generna från QuickLoad-webbplatser, som är enkla system för att katalogisera, sekvensera och andra datafiler för visualiseringsändamål. IGB tillhandahåller avancerad funktionalitet med plugin-stöd för att lägga till funktionalitet och automatisering av arbetsflöden med hjälp av skript. IGB ger dig också avancerade funktioner för att dela din data, oavsett om det är att publicera som en högkvalitativ JPEG-, PNG- eller SVG-bild eller att spara data i Dropbox för att ge dina kollegor tillgång till projektet.

IGB används främst av universitetsforskare, biologer och bioinformatiker. Den tillhandahåller avancerade verktyg för att öppna en mängd olika genomdataformat, visualisera data som olika grafer och dela data med medarbetare. Tyvärr är programmet beroende av bidrag för fortsatt utveckling, vilket gör att stödet för ansökan kan upphöra när som helst. Integrated Genome Browser förblir dock ett lämpligt, anpassningsbart program för användare som vill utforska och analysera sina genomdata.

Uppdaterad: 29 juni 2016

▶ Andra filtillägg som används Integrated Genome Browser 9